分公司如何缴纳增值税、企业所得税？一文帮您理清：分支机构常见税务问题

企业设立分支机构之后，相关的纳税申报怎么做？一文帮您理清，分支机构常见税务问题。一起来看看：

1 分支机构是否采用非独立核算和税务征管机关无关

单位纳税人办理税务登记，在填写《税务登记表》时，有一项填写内容为“核算方式”。内容共有两个选项，分别是“独立核算”和“非独立核算”。

这里的“独立核算”与“非独立核算”，是对企业设立的不具有法人资格的分支机构（以下简称分支机构）而言的。法人企业，必须“独立核算”。

很多纳税人对于不具备法人资格的分支机构的不同的核算方式，理解为“独立核算”的分支机构需要独立纳税，“非独立核算”的分支机构不需要独立纳税，这是一个错误的认知。

那么，分支机构的“独立核算”和“非独立核算”到底是怎么一回事？

“独立核算”是指分支机构单独对其业务经营活动过程及其成果进行全面、系统的会计核算。单独设置会计机构并配备会计人员，并有完整的会计工作组织体系。

“非独立核算”是指分支机构没有完整的会计凭证和会计账簿体系，只记录部分经济业务所进行的会计核算，全面核算任务由总机构完成。

分支机构采用“独立核算”或者“非独立核算”，是企业内部管理的要求，不是税务机关的要求。

2 分公司如何缴纳增值税企业所得税

增值税

分公司拥有不同于总公司的统一社会信用代码，在增值税上属于独立的纳税人，体现在以下几个方面：

01 分公司与总公司可以是不同资格的增值税纳税人，总公司是一般纳税人，分公司可以是小规模纳税人，总公司是小规模纳税人，分公司可以是一般纳税人。

02 总分公司发生应税行为，应由各自对外开具发票，不得相互替代或者委托开具发票。

03 总分公司之间，各分公司之间，如果发生增值税应税行为，也应当确认增值税，由发生应税行为一方开具发票。

04 根据规定，自2020年11月1日起，非独立核算分支机构可自愿参与纳税信用评价。所谓非独立核算分支机构是指由企业纳税人设立，已在税务机关完成登记信息确认且核算方式为非独立核算的分支机构。

企业所得税

根据《企业所得税法》第五十条第二款的规定，居民企业在中国境内设立不具有法人资格的营业机构的，应当汇总计算并缴纳企业所得税。可见，总分公司在企业所得税上是一个纳税人，2023年6号公告第一条第二款也指出，企业设立不具有法人资格分支机构的，应当汇总计算总机构及其各分支机构的从业人数、资产总额、年度应纳税所得税，依据合计数判断是否符合小型微利企业条件。

结合征管实践，分公司企业所得税的缴纳，大体可以分成三种情况。

1、并入总公司

企业所得税并入总公司缴纳，是指分公司的所得并入总公司的所得，由总公司统一预缴和汇缴，分公司不做企业所得税税种认定。这种缴纳方式通常应用于总公司与所有的分公司均注册在同一个直辖市或地级市情形。

2.汇总缴纳

汇总缴纳企业所得税，是指总分公司实行“统一计算、分级管理、就地预缴、汇总清算、财政调库”的企业所得税征收管理办法。简言之，可以概括为一次计算，两次分配。

一次计算是指，总公司与所有的分公司合在一起计算应纳税所得额和应纳所得税额；两次分配是指，第一次总公司与所有的分公司各按照50%分配缴纳所得税额，第二次各分公司按照“营业收入”“职工薪酬”“资产总额”三项因素计算的分配比例进行二次分配。

汇总缴纳企业所得税通常应用于总公司跨省级行政区域（包括跨省、自治区、直辖市和计划单列市）设立分公司的情形。请注意，只要有一个分公司是跨省，所有的分公司（包括同一个地级市的分公司），除另有规定外，均应实行汇总纳税。

5种无需就地分摊缴纳的情形

1.不具有主体生产经营职能，且在当地不缴纳增值税的产品售后服务、内部研发、仓储等汇总纳税企业内部辅助性的二级分支机构。

2.上年度认定为小型微利企业的，其二级分支机构不就地分摊缴纳企业所得税。

3.新设立的二级分支机构，设立当年不就地分摊缴纳企业所得税。

4.当年撤销的二级分支机构，自办理注销税务登记之日所属企业所得税预缴期间起，不就地分摊缴纳企业所得税。

5.汇总纳税企业在中国境外设立的不具有法人资格的二级分支机构，不就地分摊缴纳企业所得税。

3.在分公司所在地缴纳

分公司选择此种缴税方式，也同一个独立的法人一样，实行按季预缴，年底汇算。在每个季度结束的15天内应向税务机关如实申报并预缴所得税额，年底结束后5个月内由税务机关统一汇算，多退少补。

3 分支机构设立一定要注意这3个易错点

登记类型错误

登记类型错误，可能带来未享受优惠政策的风险。例如：企业登记类型为分支机构，但企业名称中不带有“分公司”等字样，实际也不是分支机构，可能引发企业未享受小微政策风险。

汇总信息错误

汇总纳税备案信息错误，部分企业应就地预缴而未就地预缴，造成企业未按规定就地预缴且参与分摊。例如：企业为前一年新成立的二级分支机构，第一年不参与分配，第二年应修改备案而未完成修改，造成未就地预缴的情况。

未及时维护信息

未及时维护汇总纳税备案信息，造成申报错误。例如：某总机构，汇算清缴年度已无有效二级分支机构，但因未及时终止备案，造成仍按照总分支机构申报方式进行汇算清缴。